El departamento de Orientación tiene a su cargo realizar prevención primaria ofreciendo información de calidad mediante la orientación individual o grupal. 

A nivel individual se realizan las orientaciones pre y post prueba, y a nivel grupal charlas informativas a instituciones públicas, empresas y ONG.

En la actualidad, en la fundación se realizan más de 6,000 pruebas anualmente acompañadas de sus respectivas orientaciones Pre y Post, en las que los orientadores dan información y aclaran cualquier duda que presenten los usuarios.

Anualmente el Departamento de Orientación realiza unas 250 charlas a nivel nacional.  Y ha llegado a través de los años a 56,645 personas por medio de ferias de salud, charlas generales y talleres.

PROBIDSIDA ha realizado desde este departamento orientación individual a 36,000 personas en 14 años brindando un servicio personalizado, amigable y libre de estigma y discriminación.